Le choix de système des dossiers médicaux électroniques est considéré comme une décision cruciale et importante qui nécessite une grande planification.
A l’étape de planification, les opinions diffèrent sur le moment approprié de choisir le dossier médical électronique. D’une part, certaines personnes développent les critères de sélection qu’ils veulent utiliser au cours de processus de planification, d’autre part, certaines d’autre commencent par choisir le système de dossier médical puis ils réalisent un plan pour soutenir ce système. D’ailleurs, la plupart de concernés par ce sujet préparent un plan initial pour identifier leurs objectifs principaux, puis, ils déterminent le système de dossier médical électronique qui garantit ces objectifs et finalement ils rectifient leurs plan pour qu’il soit adapté après la sélection.
La clinique ou l’hôpital établissent leurs objectifs et prévoient l’influence des dossiers de santé électroniques sur l’avancement de travail, après, l’équipe désigné ont la possibilité de sélectionner le système de dossiers de santé électroniques. Il existe plusieurs considérations citées comme suit :

• Est-ce que le produit répond aux besoins cherchés ? Que ce que le programme nécessite pour qu’il soit bénéfique ?
  
• Clarifier le coût avant de choisir le système des dossiers de santé électroniques (le matériel, les logiciels, la maintenance, le coût de communication et l’échange des informations médicales, les rapports de qualité selon la demande,…).
  
• Identification de la période de la subvention de l’application (montant, …)
  
• Préciser les rôles, les responsabilités et le coût pour la stratégie de transfert de données à partir du papier au support électronique et sélectionner les données qui peuvent faciliter l’opération de transfert.
  
• Options du serveur (par exemple client-serveur chargé par les services des applications (ASP), les logiciels comme le SAS).
  
• La capacité d’intégration avec d’autres produits (par exemple les programmes de gestion des usines, les systèmes de facturation, les organismes de santé publique).
  
• L’aptitude de sécurité et la planification de réserve.
  
• Fournir des primes pour les médecins et le personnel pour les encourager à travailler avec dossiers médicaux électroniques.
  
• La stabilité de la société qui fournit ces systèmes.
  
• Considérer le coût de travail d’un avocat pour la mission de control des contrats.